阿勒泰地区辖1个县级市、6个县：阿勒泰市、布尔津县、哈巴河县、吉木乃县、福海县、富蕴县、青河县。

共有3个街道、13个镇、41个乡，68个社区、506个村委会。境内还有新疆生产建设兵团农十师的十个团场。