亳州市共有高中47所（含职高综合班）。

省级示范中学有亳州一中、亳州二中、涡阳四中、蒙城一中。市级示范中学有亳州三中、亳州五中、涡阳一中、涡阳二中、涡阳三中、蒙城二中、利辛一中、利辛二中。其余中学有亳州市职院附中、亳州市二高职、亳州市大寺中学、亳州市双沟中学、涡阳县实验中学、涡阳县曙光中学、涡阳县龙山中学、涡阳县文武学校等35所。