民国85年1月24日，中华民国总统李登辉特将其两枚国玺连同其他的中华民国总统官印，职务印章等印信一起改由总统府监印官负责保管，而国玺保存地点则由位于总统府附近之警备总部附设的地下防空堡垒移至府内之保险箱。