指标生和自主招生的区别主要是概念不同，指标生是普通高中拿出部分招生计划分配到一定范围的学校，而以指标的身份进入高中就读的考生则被称为指标生。

而自主招生又称自主选拔，是高校选拔录取工作改革的重要环节。通过高考自主招生笔试和面试之后，可以享受相应的高考降分政策。