1、物流公司发生运费收入时，借：银行存款，贷：主营业务收入 应交税费-应交增值税（销项税额）；2、物流公司发生其他运费支出且取得对应发票时，借：管理费用-运费（根据费用所属部门计入相关科目） 应交税费-应交增值税（进项税额），贷：银行存款。