合同纠纷保存证据应该对《合同书》及有关协议，以及当事人约定纳入合同内容的有关资料完整保存。

在合同履行过程中当事人向对方履行了合同的证据要保存。在合同履行过程中向对方发送的告知、通知、提出的异议。《民事诉讼法》第二十三条规定，因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。