蒙古帝国是元朝和西征建立的四大汗国所组成的联合大帝国，而元朝只是蒙古国的一部分。

元朝是一个政治实体。蒙古大帝国是个松散的部落联盟，不是一个政治实体，只能说是几个国家组成联盟。元朝是中原王朝，是中国历史的一部分，而蒙古帝国不是中原王朝历史一部分。简言之元朝是蒙古帝国的一部分，在蒙古帝国内战后的一段时间内与蒙古帝国内其他国家都各自为政，直到黄金家族和解之后，约定名义上重新承认元朝皇帝为蒙古帝国大汗，彼此间设驿路、开关塞恢复往来。