武汉地铁超时费用的计算方法如下：

当乘客从进闸到出闸的时间超过240分钟时，对于单程票、二维码车票、普通储值票、纪念币储值票、武汉通储值类票卡、银联闪付卡等，需要按照最高单程票价来补交超时车费。

举例来说，如果乘客在17时39分进闸，然后在21时41分出闸，由于时间超过240分钟，因此需要按照最高单程票价来补交超时车费，扣费为13元。

请注意，以上信息仅供参考，具体扣费标准可能因票种、优惠政策等因素有所不同。如有疑问，可咨询武汉地铁的客服人员或查看相关的票务规定。

武汉地铁超时费用是根据超时时间和超时区间收取的，具体收费标准如下：超时1-5分钟，收取2元；超时6-10分钟，收取4元；超时11-15分钟，收取6元；每逾5分钟加收2元，超过30分钟的按照最高20元收取。超时区间分为普通区间和控制区间，普通区间内超时收取2元，控制区间内超时按照上述标准收取。

车站内也有超时限额，超时不满1分钟不收费，超时1分钟以上最高收费为2元。