一般情况下，经侦支队下设四个以上大队：金融犯罪侦查大队，市场犯罪侦查大队，公司犯罪侦查大队和涉税犯罪侦查大队。多数支队都设有情报大队。另外还有办公室或者综合科或者秘书科。大点儿的支队还有法制科和外协大队，小支队的法制和外协职能一般都合并到了综合部门。

如杭州经侦支队就设有十多个下属部门，除了上述部门，还有政工科，基础大队，举报中心等。