合肥南站是可以在站内换乘的。当需要在合肥南站进行换乘时，可以在下车换乘前再次核对自己的车票，是否是在合肥南站进行换乘搭乘下一趟车次，注意听车上广播及时下车以免坐过车，下车后可以询问高铁站内的工作人员寻找换乘地点。