其实无所谓的．南京是省城，综合势力补角强，而昆山是新兴城市，在吸引外商投资，发展新兴产业方面拥有巨大的潜力．二者在发展前景方面是差不多的．两个城市都是江苏的，在很多方面都有相似之处．况且，在流动性如此之大的今天，户口已经不是什么大问题了．如果你准备定居在昆山，那就落户在昆山，这样以后孩子上学等方面比较方便．如果你以后要回南京，那么户口还是落在南京比较好．