员工旷工的处理方式如下：第一次旷工，通过口头或书面警告，让本人认识到错误的严重性并且责令反省。第二次旷工，以全公司通报批评的方式警示本人及其他员工，并由主管领导进行谈话，记大过处分。第三次旷工，开除或劝退。