企业职工缴纳的大额医疗保险不能免征个人所得税。根据财税〔2006〕10号文件第一条：因企业职工所缴付的大额医疗保险不属于国家规定或省市规定的基本医疗保险，费用一般超过基本医疗保险费，因此需要将大额医疗保险费的超过部分计入职工当月的工资、薪金所得进行个人所得税的征收。