银行扣利息但是余额不足，各个银行的处理方式不同。

这里以招商银行为例，若招行一卡通贷款当天扣款金额不足或错过扣款时间，可通过以下方式操作还款：若今日是贷款还款日(不包括已逾期贷款)，可操作“当日紧急还款”；网银、手机银行支持对逾期90天内的贷款进行还款(支持住房贷款、消费贷款、闪电贷，小微贷款，行员贷款等)；将欠款资金足额存入还款账户，等待系统每天自动补扣。