毛坯房顶子不平可以采取以下几种处理方式：

1.找专业工人测量，并使用水泥、石膏等材料打底，再用水准仪进行调整；

2.使用专业的填平工具，如自流平水泥、防水涂料等，将不平的地方填平；

3.在毛坯房顶子上铺设木板或者石块等物品，使其更加平整；

4.如果不平的程度不是很严重，也可以使用装修材料进行修补，如瓷砖、地板等。不管采取哪种方法，都应该在确保安全的前提下，仔细斟酌，选择最适合自己的处理方式。