南京地铁3号线一共29地铁站，分别为秣周东路、东大九龙湖校区、诚信大道、九龙湖、天元西路、胜太西路、宏运大道、南京南站、明发广场、大明路、卡子门、雨花门、武定门、夫子庙、常府街、大行宫、浮桥、鸡鸣寺、南京林业大学·新庄、南京站、小市、五塘广场、上元门、柳洲东路、天润城、泰冯路、东大成贤学院、星火路、林场。