应该根据工程项目内容来分类归档，比较有房地产工程项目，可以将房地产的房屋建筑合同，水电安装合同，绿化合同，安装合同，燃气合同等先按类后集中进行统一归档，便于查询。

建筑工程合同首先按年代统一编号，然后统一登记造册，最后按工程类别进行分类存档，可分房屋建筑合同，工程建筑合同，其他另星建筑合同等。