大学植物保护专业的排名依次为南京农业大学、浙江大学、中国农业大学、福建农林大学、华中农业大学、贵州大学、西北农林科技大学、山东农业大学、华南农业大学、西南大学、云南农业大学这几所大学的专业排名都是在B级以上的。