低保住院自费部分是不可以申请临时救助的。因为低保户住院花费的医疗费用本身报销的标准就比普通农户的要高一些。按照政府部门规定的政策不论是低保户还是普通农户只要是住院自费部分超过5000元以上的，可以向当地民政局申请大病救助金。

低保人员因患病住院治疗未事先申请临时救助的，出院后个人自费医疗费用达到2000元以上时，可申请临时救助1次，根据自费数额情况临时救助600—6000元