如果圆通快递的投诉被认可并已经开始执行罚款程序，那么即使投诉被撤销，罚款程序仍然会继续进行。但是，如果罚款程序还没有开始或者已经在进行中但还没有达到必要的阶段，那么撤销投诉可能会使罚款程序终止，不会再对客户进行罚款。这取决于圆通快递的公司规定和具体情况。