有三种方案：

1、从淮南出发，经过蚌淮高速，宁洛高速凤阳支线，宁洛高速到达南京市。

总路程243、2公里，大约3小时1分到达；

2、从淮南出发，经过蚌淮高速，宁洛高速凤阳支线，宁洛高速，天潜高速，沪陕高速到达南京市。总路程262、2公里，大约3小时18分到达；

3、从淮南出发，经过蚌合高速，合肥绕城高速，沪陕高速到达南京市。总路程264、2公里，大约3小时33分到达。因此经过对比，建议自驾走蚌淮高速，宁洛高速凤阳支线，宁洛高速到达南京市。