如果自建房是有房产证的，那么就可以用公积金进行贷款。北京自建房不同于一般的商品房，没有专门的房地产企业去开发建设，多是村民为了满足自己的需求而建造的，因为大多不被国家认可，因此也无法办理贷款，但若是有房产证，北京自建房一样可以办理公积金贷款。

办理北京自建房公积金贷款，一定要无未结清的住房公积金贷款，在办理建房许可证２４个月内且现场核实确认北京自建房工程主体建造一层以上办理。