企业可以通过以下途径查询员工学历：

首先，可以要求员工提供相关学历证明文件，如学位证书、毕业证书等。

其次，可以联系员工所在的学校或教育机构，向其核实员工的学历信息。此外，一些国家或地区设有学历认证机构，企业可以向这些机构查询员工的学历认证情况。

还可以通过第三方背景调查公司进行学历验证，这些公司会通过与学校或教育机构的联系，核实员工的学历信息。

企业在查询员工学历时，应遵守相关法律法规，确保信息的合法性和保密性。