医保卡报销流程如下：

1、医保住院，出示医保卡，读卡进医保系统，交押金（一般都是门槛费）；

2、发生费用录入系统，系统自动分类为自费、甲类、乙类等，乙类先自付10%，再进入基本医疗，按照年度住院次数（大于1次门槛费减半）、医院级别（门槛费不同、统筹比例不同）；

3、由电脑计算应该自己付多少钱，医院再向社保的医保中心结算多少钱。