动物近亲繁殖会产生很多不良后果，无论是人工饲养的猪羊鸡狗等家畜，还是狮虎豹等野生动物，近亲繁殖产生的后代都往往体弱多病，存活机会较少。

由于许多遗传基因只有在它们并存于双亲的基因中时才显现出其消极的一面，而双亲的亲缘关系越近，它们的基因特性雷同的机会就越大。