在学科划分上，生物科学属于理学专业；而生物工程属于工学专业。也就是说生物科学更倾向于基础研究，而生物工程更倾向于生产实践。

在课程安排上，生物科学在生物学大学科相关课程涉及较多，如：动物学、植物学、微生物学、细胞生物学等。而生物工程，在工程学课程的细分专业上涉及较多，如：分子生物学技术、发酵工程、细胞工程、生物化工等。