农保住院根据不同医院，报销的比例也有所不同：

1、一级医院：起付线300元，没有设置补偿费用分段，报销比例为65%。

2、二级医院：县二级医院起付线400元，补偿费用在6000元以下的报销比例为65%，6000元以上报销比例为80%。市二级医院起付线600元，补偿费用分段在6000元以下报销比例65%，6000元以上报销比例80%。

3、三级医院：县三级医院起付线600元，补偿费用分段在6000元以下报销比例65%，6000元以上报销比例80%。市三级医院起付线800元，补偿费用在12000元以下报销比例为55%，12000元以上报销比例为75%。