农村医保350元是国家标准，725元是地方标准，这是二者的第一个区别。

农村医保350元和725元的第二个区别，应该是在报销上有区别。如果按国家要求，350元国家补贴610元达到960元的门诊报销上限，那么725元的门诊报销上限就可以达到1400元。其次，在住院报销比例上，农村医保725元的报销比例应该比350元的多5%左右，即住院费用中有7000元可报销，那么350元的按50%报，就是3500元。那么交725元，就可以按55%报，达到3850元。

最后，新农合缴费标准不同，相应的地方医保中心会给出相应的解释。

医保350和725指的是医保缴费的档次不同，350指一档，725指二档。城乡居民医保中一档二档的缴费不一样，报销不一样，而且一档二档缴费在门诊慢性病支付标准及居民“两病”保障上也有差别，一档缴费的，在实施基本药物制度的一级医院发生的住院医疗费用按83%支付，按二档缴费的，一级医院按88%支付