审计发现工程围标串标，应采取以下处理措施：

1.立即报告：将发现的围标串标情况及时向上级主管部门、纪检监察机关或相关执法部门报告。

2.暂停项目：暂停相关工程项目的实施，以防止问题进一步扩大和造成更严重的后果。

3.深入调查：配合有关部门对围标串标行为进行深入调查，包括审查招投标文件、合同、资金流向、相关人员的通信记录等，以获取充分的证据。

4.处罚相关责任方：根据调查结果，对参与围标串标的企业和个人依法予以处罚。处罚方式可能包括罚款、取消投标资格、吊销营业执照、追究刑事责任等。

5.重新招标：如果围标串标行为导致原招标结果无效，应依法重新组织招标，确保项目能够公正、公平地推进。

6.完善制度：总结经验教训，分析围标串标发生的原因，完善招投标管理制度和监督机制，加强对招投标活动的全过程监管，预防类似问题再次发生。

7.警示教育：对相关行业和企业进行警示教育，宣传法律法规，提高各方的守法意识和合规经营意识。

总之，对于工程围标串标行为，必须严肃处理，以维护市场秩序和公共利益。