蓬莱有两个客运码头，蓬莱港和蓬莱新港。蓬莱港在蓬莱市区西边，海港路，海洋极地世界旁边，是到长岛的客运码头，即蓬长客港客运站。蓬莱新港在市区东边，蓬莱开发区哈尔滨路，是到旅顺的客运码头。