归卫健委管理。卫健委是地方各级医院的主管部门。下设办公室、医政科、健教所、爱卫会等职能部门，分管食品卫生，执业医师法的实施，医疗事故的处理等等工作。

各省和市一级的妇幼保健院归省和市卫健委管理，县和区一级的妇幼保健院归县和区卫健委管理。