北京医保报销不是从医保账户里扣。北京医保报销是指持医保卡就医，超过起付线以后，在看病交费结算时应报销部分直接从医保基金中支付，个人只需支付医保报销后个人应承担的部分。

而医保账户指的是北京银行的医保返还存折，每个月医保中心都会将该返还的钱打入医保存折中，这个钱可以取出来买药看病等，但看病时并不能从这个账户直接抵扣，这个账户并不与医保卡关联。