是的，根据搜索结果，使用JR PASS可以在由布院和熊本之间旅行。JR PASS是一种日本铁路通票，允许持有者在特定的时间内无限次乘坐JR线路的列车。对于从由布院到熊本的行程，您可以使用JR PASS来乘坐连接这两个城市的JR线路