应届生签订就业协议书时，一般应该先进行体检。因为体检是保证毕业生身体健康的重要环节，也是保证毕业生能够顺利就业的重要保障。在签订就业协议书时，如果毕业生身体存在问题，可能会影响就业，甚至造成不良后果。

因此，一般建议毕业生先进行体检，确保身体健康后再签订就业协议书。当然，具体情况还需要根据实际情况和学校要求来确定。