在任何城市(包括南京市)汽车违停是可以申诉的。

对违停处罚不服，当事人可以向同级人民政府或上级业务主管部门申请行政复议，也可以提起行政诉讼，胜诉后可以撤销违停的相关处罚。不过，既然违停已被处罚了，就说明违停行为已经违反了相关规定，违停不是以时间长短来定性，而是以事实构成来定论，不说是５分钟，就是几十秒都不行。在没有充分证据证明违停行为不违反法律的情况下，任何的申诉都是徒劳的，胜诉的可能性基本上是没有的。