项目的不同审计费用收取的比例也不同 ，一般是审计项目的0.3%~0.5% 。

工程决算审计基本收费一般定为建设单位送审总造价的0.3--0.5%左右，追加收费一般定为中价机构审减金额的4--9%左右。而审计服务费用由建设单位支付，在工程投资中单独列支(国家财务部有相关规定)。政府肯定是有作出相关规定的，而且每个地区的规定都有所差异。