可以。如果你在抖音上开店被举报侵权，但你拥有相关商品的合法授权证明，可以凭借该证明向抖音进行申诉。在申诉时，你需要详细陈述授权的情况，并提供相关证明材料。

如果你的授权证明和证据充分、真实可信，那么你的申诉有很大可能成功获得抖音的支持和认可。不过请注意，抖音的审核和处理流程较为繁琐，需要耐心等待。另外，在日常经营中也需要合法经营，严格遵守知识产权、商标等相关法律法规。