全线共设董集站（接轨站）、灌云站、灌南站、涟水站、淮安东站、宝应站、高邮北站、高邮高铁站、邵伯站（线路所）、扬州东站、江都站（接轨站）、泰安站（接轨站）、镇江大港站、横山站（技术站）、丹徒站（接轨站）和镇江站（接轨站）16个车站。