北京大学和北方交通大学相同点是都在北京市，都是教育部直属院校，也是985、211双一流大学，除此之外两所大学没有什么关心，北京大学实力和名气要大很多，两所大学无可比性。北京大学是综合类大学，文理科较为平衡，而北方交通大学偏理工科一些。

地理位置都在北京，北京大学属于全国高校，北方交通大学属于北京市属高校。