深圳的社保比其地方低是因为特殊地理位置所决定的。

深圳市基本医疗保险根据缴费及对应待遇分设一档、二档、三档三种形式。今后的退休金会不一样的，所获得的退休金待遇也会高一些。同样的缴费年限，退休的社平工资越高，他的养老待遇就越高，所以深圳社保交的少反而退休金还高。