秦始皇都城在咸阳，秦都咸阳，位于今陕西咸阳市以东十公里处的长陵车站、窑店镇和尚家村车站一带，范围约东西十二里，南北十五里。

城址原在渭河以北，后因渭河北移，现今南部已经处于渭河以南。据近年考古发掘，宫殿遗址多在城北山塬上，以窑店镇一带最为密集，地势居高临下，便于控制全城，西南部城外为手工业作坊区和居民区。咸阳从秦孝公十二年（前350）定都到秦二世三年（前207）秦朝灭亡，建都时间达一百四十三年之久。