考南京邮电大学比考南京工程大学更好。考南京邮电大学更好的原因如下：

1. 学校的综合实力：南京邮电大学在电气工程自动化专业方面具有较强的实力和声誉，其教学质量和科研水平都处于领先地位。它拥有一流的师资队伍和先进的实验设备，能够为学生提供更好的学习和研究条件。

2. 学科专业优势：南京邮电大学在电子信息领域有较深的积累和研究优势，在电气工程自动化专业方面有更多的研究方向和机会，能够为学生提供更广泛的学习和研究领域。同时，学校还有较为完善的实践教学环境，可以提升学生的实践能力和就业竞争力。

3. 就业前景和发展机会：南京邮电大学的电气工程自动化专业毕业生就业率较高，校企合作和校内招聘会等就业资源也较为丰富，为学生提供了更多的就业机会和发展空间。当然，选择学校还需要综合考虑个人的兴趣、适应能力和未来的发展规划。建议你在选择之前，详细了解两所学校的课程设置、实验室条件、科研项目和就业情况，对比权衡，找到最适合自己的选择。

南京邮电大学，因为，他这个专业属于国家特色专业。