善意取得中的善意就是对占有不动产登记等权利外观的依赖，善意第三人善意则是包括不知道或者无过失的不知道某些法律事实，包括权利，法律行为，单纯的事实等等。

简而言之，就是善意取得中，当事人知道一些事实被认为是善意。善意第三人则是当事人不知道一些事实，而被认定是善意。