一般来说，年底住院的医保跨年结算分为以下步骤：及时办理出院手续：在年底住院时，应该及时办理出院手续，并保留好相关发票和医疗记录。持医保卡办理入院手续：在跨年期间再次住院时，需要持医保卡办理入院手续，并告知医生自己已经办理过出院手续。申请跨年度报销：将两次住院的发票和相关医疗记录提交给医保部门，申请跨年度报销。等待审核和结算：医保部门会对申请进行审核，并根据规定进行结算。需要注意的是，不同地区的医保政策可能存在差异，具体结算流程和时间可能会有所不同。此外，在跨年期间，医保卡可能存在无法使用的情况，因此需要及时了解相关政策，以免影响自己的医疗保障。

按住院第一天日期算，第一天是那一年，就按那一年医保规定算。