个体工商户营业执照正本丢失了副本还在，办理注销手续不需要任何费用的。根据国家有关放管服政策以及个体工商户注销登记的有关规定，个体户营业执照正本丢失后，应当在国家企业信用信息公示系统进行丢失公告期限期满后，再进行办理注销手续，不收取任何费用。

个体户营业执照正本丢了，副本还在，要注销无需花钱，可以直接去原登记机关办理注销登记。