住院执行单是一种重要的医疗文件，需要妥善保管。当患者出院或者执行单过期后，应该及时销毁。销毁方式可以选择烧毁、撕碎、粉碎等方式，确保文件不被泄露。

销毁前应先检查执行单内容是否完整，是否有重要信息未处理，以防止信息泄露。对于电子执行单，应按照规定的流程进行删除或者销毁，不得随意删除，防止信息被恶意利用。销毁完毕后应及时清理现场，确保文件不被他人拾取。

住院执行单需要与病历一起保存，存放在档案室内，保存30年，在没有上级主管部门批示下，不可以销毁。