重庆工程学院有两个校区，分别为双桥校区和南泉校区，它们的区别如下：

1、地理位置不同。重庆工程学院南泉校区位于重庆市巴南区，双桥校区位于重庆市双桥经济开发区。

2、学历设置不同。一般本科生在重庆工程学院双桥校区，专科生在重庆工程学院南泉校区。