重庆医科大学创建于1956年，由上海第一医学院（现复旦大学上海医学院）分迁来渝组建而成，原名重庆医学院，1985年更名为重庆医科大学。学校是国务院学位委员会批准的首批具有博士和硕士学位授予权的单位。

2015年，成为重庆市人民政府、国家卫生计生委和教育部共建高校。

学校由位于渝中区的袁家岗校区和位于重庆大学城的缙云校区组成，校园总面积2650余亩。其中，缙云校区占地2100余亩，校园环境优美，风景如画。