资质平移是指将企业原有的施工资质、设计资质、勘察资质等，转移到另一家企业名下的行为。在资质平移后，原企业将不再具备相应的资质，因此在建工程可能需要进行以下处理：

1. 办理资质变更手续：由于原企业的资质已经平移至另一家企业，因此在建工程需要进行资质变更手续，将原企业的资质变更为新企业的资质。

2. 确认原企业的责任：在建工程中，原企业可能仍需承担一定的责任，因此需要对原企业的责任进行确认和协调处理。

3. 新企业负责继续工程施工：新企业将接管原企业的资质，需要负责继续完成在建工程的施工任务，确保工程顺利进行。

4. 合同协商：原企业和新企业需要对在建工程相关合同进行协商，对工程进度、质量、付款等进行沟通和协调，确保工程顺利进行。

总之，资质平移后对在建工程的处理需要原企业和新企业进行合作，确保工程顺利完成，并对合同、责任等进行适当的协商和处理。

在建工程仍由平移后的企业继续施工完成。