事业单位是由编制委员会批准设立的。根据工作需要，由要成立事业单位的主管部门向编委会提出申请，编委会根据要成立的事业单位工作职能研究通过对机构，编制，领导职数，工作职能进行审定，通过后下达文件，即可成立该事业单位，也就是平时说的三定方案。因此事业单位是由编委会批准设立的。